Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps53Q8CCB4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps53Q8CCB4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps53Q8CCB4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms