Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp3Q8C7U1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4bp3Q8C7U1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms