Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifi27Q8C6G0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi27Q8C6G0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms