Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E0

Cfap36, Cilia- and flagella-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap36Q8C6E0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap36Q8C6E0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap36Q8C6E0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap36Q8C6E0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap36Q8C6E0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap36Q8C6E0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms