Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rft1Q8C3B8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rft1Q8C3B8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rft1Q8C3B8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rft1Q8C3B8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms