Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C1R3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C1R3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C1R3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C1R3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C1R3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms