Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf428Q8C1M2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf428Q8C1M2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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