Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp37Q8C0R0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms