Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
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Rapgef5Q8C0Q9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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Rapgef5Q8C0Q9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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Rapgef5Q8C0Q9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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Rapgef5Q8C0Q9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Rapgef5Q8C0Q9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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Rapgef5Q8C0Q9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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Rapgef5Q8C0Q9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Rapgef5Q8C0Q9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Rapgef5Q8C0Q9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Rapgef5Q8C0Q9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef5Q8C0Q9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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