Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim47Q8C0E3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim47Q8C0E3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms