Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccser1Q8C0C4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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