Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx22Q8C084 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms