Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Trerf1Q8BXJ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Trerf1Q8BXJ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trerf1Q8BXJ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms