Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm4aQ8BW72 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms