Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc12Q8BW49 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc12Q8BW49 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ttc12Q8BW49 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms