Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx17Q8BVL3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms