Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep55Q8BT07 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep55Q8BT07 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms