Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Pbrm1Q8BSQ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms