Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10600Q8BQ57 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10600Q8BQ57 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms