Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp54Q8BL06 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp54Q8BL06 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms