Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbfox3Q8BIF2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms