Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Frmd4aQ8BIE6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms