Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabra5Q8BHJ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms