Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vipas39Q8BGQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms