Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox2Q8BG99 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms