Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo1Q8BFY9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 791.8 ms