Protein–RNA interactions for Protein: Q811W2

Cyp26b1, Cytochrome P450 26B1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26b1Q811W2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26b1Q811W2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp26b1Q811W2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26b1Q811W2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms