Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc172Q810N9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms