Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm5bQ80Y84 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5bQ80Y84 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms