Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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