Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aldh3b1Q80VQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms