Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2eQ80UW8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2eQ80UW8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232 ms