Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actr5Q80US4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actr5Q80US4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms