Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Avl9Q80U56 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Avl9Q80U56 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms