Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CyldQ80TQ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CyldQ80TQ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CyldQ80TQ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CyldQ80TQ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms