Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
NischQ80TM9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
NischQ80TM9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC44.24■■■■■ 4.67
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NischQ80TM9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
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NischQ80TM9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC44.2■■■■■ 4.67
NischQ80TM9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
NischQ80TM9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
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NischQ80TM9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
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NischQ80TM9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
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NischQ80TM9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
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NischQ80TM9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
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NischQ80TM9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
NischQ80TM9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
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NischQ80TM9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
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NischQ80TM9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
NischQ80TM9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
NischQ80TM9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NischQ80TM9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NischQ80TM9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
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NischQ80TM9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms