Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp6r1Q7TSI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp6r1Q7TSI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp6r1Q7TSI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp6r1Q7TSI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp6r1Q7TSI3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp6r1Q7TSI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp6r1Q7TSI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp6r1Q7TSI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp6r1Q7TSI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppp6r1Q7TSI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms