Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf516Q7TSH3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf516Q7TSH3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf516Q7TSH3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.1 ms