Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg1cQ7TSF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms