Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RgmbQ7TQ33 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RgmbQ7TQ33 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RgmbQ7TQ33 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms