Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prrc2bQ7TPM1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prrc2bQ7TPM1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms