Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk40Q7TNL3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk40Q7TNL3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stk40Q7TNL3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms