Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp3Q7TNH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp3Q7TNH6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms