Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg2Q7TMS5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms