Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms