Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms