Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msrb2Q78J03 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msrb2Q78J03 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms