Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SynmQ70IV5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SynmQ70IV5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SynmQ70IV5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms