Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms