Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp34Q6ZQ93 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms